Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A2P50993 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A2P50993 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms