Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX5P50542 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX5P50542 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX5P50542 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX5P50542 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX5P50542 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX5P50542 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX5P50542 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX5P50542 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX5P50542 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX5P50542 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX5P50542 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX5P50542 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX5P50542 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX5P50542 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX5P50542 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX5P50542 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX5P50542 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX5P50542 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX5P50542 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX5P50542 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX5P50542 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX5P50542 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX5P50542 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX5P50542 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX5P50542 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX5P50542 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX5P50542 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX5P50542 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX5P50542 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX5P50542 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX5P50542 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX5P50542 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX5P50542 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX5P50542 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX5P50542 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX5P50542 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX5P50542 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX5P50542 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX5P50542 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX5P50542 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PEX5P50542 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PEX5P50542 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX5P50542 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX5P50542 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX5P50542 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX5P50542 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX5P50542 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX5P50542 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX5P50542 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX5P50542 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX5P50542 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX5P50542 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX5P50542 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX5P50542 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX5P50542 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX5P50542 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX5P50542 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX5P50542 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX5P50542 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX5P50542 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX5P50542 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX5P50542 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX5P50542 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX5P50542 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms