Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IDH3AP50213 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms