Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIG4P49917 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIG4P49917 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIG4P49917 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIG4P49917 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG4P49917 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG4P49917 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG4P49917 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG4P49917 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG4P49917 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG4P49917 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG4P49917 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG4P49917 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG4P49917 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIG4P49917 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIG4P49917 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIG4P49917 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIG4P49917 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG4P49917 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG4P49917 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG4P49917 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG4P49917 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG4P49917 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG4P49917 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIG4P49917 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIG4P49917 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG4P49917 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG4P49917 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG4P49917 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG4P49917 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG4P49917 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG4P49917 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG4P49917 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG4P49917 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIG4P49917 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG4P49917 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG4P49917 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG4P49917 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG4P49917 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG4P49917 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG4P49917 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG4P49917 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG4P49917 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG4P49917 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG4P49917 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG4P49917 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG4P49917 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIG4P49917 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG4P49917 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG4P49917 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG4P49917 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG4P49917 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG4P49917 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG4P49917 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG4P49917 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG4P49917 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG4P49917 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG4P49917 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG4P49917 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG4P49917 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIG4P49917 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG4P49917 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG4P49917 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG4P49917 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG4P49917 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG4P49917 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG4P49917 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG4P49917 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG4P49917 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG4P49917 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG4P49917 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG4P49917 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG4P49917 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIG4P49917 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG4P49917 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG4P49917 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG4P49917 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG4P49917 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG4P49917 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG4P49917 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG4P49917 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIG4P49917 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIG4P49917 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIG4P49917 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIG4P49917 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms