Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGS4P49798 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGS4P49798 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGS4P49798 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGS4P49798 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGS4P49798 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGS4P49798 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGS4P49798 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGS4P49798 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGS4P49798 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGS4P49798 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RGS4P49798 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGS4P49798 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGS4P49798 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGS4P49798 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGS4P49798 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGS4P49798 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGS4P49798 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGS4P49798 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGS4P49798 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGS4P49798 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGS4P49798 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGS4P49798 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RGS4P49798 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGS4P49798 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGS4P49798 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGS4P49798 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RGS4P49798 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGS4P49798 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGS4P49798 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGS4P49798 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGS4P49798 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGS4P49798 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGS4P49798 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGS4P49798 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RGS4P49798 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGS4P49798 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGS4P49798 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGS4P49798 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGS4P49798 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGS4P49798 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGS4P49798 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGS4P49798 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RGS4P49798 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGS4P49798 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGS4P49798 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RGS4P49798 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGS4P49798 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGS4P49798 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RGS4P49798 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGS4P49798 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGS4P49798 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGS4P49798 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGS4P49798 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGS4P49798 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGS4P49798 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGS4P49798 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGS4P49798 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGS4P49798 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGS4P49798 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RGS4P49798 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGS4P49798 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGS4P49798 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGS4P49798 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RGS4P49798 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms