Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VEGFBP49765 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms