Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMB2P49721 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms