Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PXNP49023 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PXNP49023 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PXNP49023 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PXNP49023 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PXNP49023 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PXNP49023 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PXNP49023 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PXNP49023 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PXNP49023 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PXNP49023 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PXNP49023 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PXNP49023 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PXNP49023 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PXNP49023 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PXNP49023 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PXNP49023 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PXNP49023 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PXNP49023 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PXNP49023 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PXNP49023 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PXNP49023 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PXNP49023 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PXNP49023 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PXNP49023 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PXNP49023 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PXNP49023 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PXNP49023 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PXNP49023 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PXNP49023 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PXNP49023 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PXNP49023 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PXNP49023 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PXNP49023 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PXNP49023 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PXNP49023 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PXNP49023 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PXNP49023 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PXNP49023 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PXNP49023 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PXNP49023 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PXNP49023 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PXNP49023 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PXNP49023 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PXNP49023 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PXNP49023 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PXNP49023 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PXNP49023 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PXNP49023 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXNP49023 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXNP49023 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXNP49023 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PXNP49023 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXNP49023 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXNP49023 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXNP49023 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXNP49023 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXNP49023 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXNP49023 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXNP49023 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXNP49023 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXNP49023 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXNP49023 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXNP49023 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXNP49023 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXNP49023 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXNP49023 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXNP49023 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXNP49023 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXNP49023 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXNP49023 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXNP49023 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PXNP49023 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PXNP49023 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PXNP49023 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PXNP49023 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PXNP49023 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PXNP49023 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PXNP49023 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PXNP49023 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PXNP49023 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PXNP49023 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXNP49023 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXNP49023 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXNP49023 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXNP49023 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXNP49023 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXNP49023 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXNP49023 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXNP49023 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXNP49023 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXNP49023 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXNP49023 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXNP49023 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PXNP49023 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PXNP49023 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PXNP49023 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PXNP49023 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PXNP49023 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PXNP49023 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms