Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC9A3P48764 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A3P48764 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A3P48764 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A3P48764 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A3P48764 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A3P48764 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A3P48764 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A3P48764 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A3P48764 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC9A3P48764 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3P48764 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3P48764 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3P48764 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3P48764 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC9A3P48764 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms