Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT6CP48668 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT6CP48668 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT6CP48668 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT6CP48668 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT6CP48668 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT6CP48668 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT6CP48668 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT6CP48668 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT6CP48668 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT6CP48668 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT6CP48668 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT6CP48668 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT6CP48668 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT6CP48668 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT6CP48668 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT6CP48668 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT6CP48668 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT6CP48668 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT6CP48668 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT6CP48668 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT6CP48668 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT6CP48668 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT6CP48668 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT6CP48668 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT6CP48668 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT6CP48668 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT6CP48668 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT6CP48668 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT6CP48668 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT6CP48668 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT6CP48668 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT6CP48668 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT6CP48668 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT6CP48668 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT6CP48668 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT6CP48668 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT6CP48668 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT6CP48668 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT6CP48668 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT6CP48668 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT6CP48668 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT6CP48668 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT6CP48668 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT6CP48668 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT6CP48668 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms