Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR4P46093 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR4P46093 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR4P46093 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR4P46093 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR4P46093 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR4P46093 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPR4P46093 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR4P46093 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR4P46093 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR4P46093 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR4P46093 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR4P46093 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR4P46093 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR4P46093 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR4P46093 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR4P46093 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR4P46093 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR4P46093 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR4P46093 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPR4P46093 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPR4P46093 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR4P46093 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR4P46093 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR4P46093 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR4P46093 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR4P46093 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR4P46093 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR4P46093 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR4P46093 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR4P46093 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR4P46093 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR4P46093 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR4P46093 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR4P46093 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPR4P46093 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR4P46093 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR4P46093 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR4P46093 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR4P46093 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR4P46093 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR4P46093 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR4P46093 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR4P46093 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR4P46093 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPR4P46093 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPR4P46093 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPR4P46093 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPR4P46093 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR4P46093 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR4P46093 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR4P46093 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR4P46093 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR4P46093 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR4P46093 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR4P46093 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR4P46093 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR4P46093 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR4P46093 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR4P46093 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR4P46093 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPR4P46093 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPR4P46093 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPR4P46093 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPR4P46093 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPR4P46093 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPR4P46093 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPR4P46093 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GPR4P46093 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPR4P46093 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPR4P46093 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPR4P46093 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPR4P46093 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPR4P46093 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPR4P46093 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPR4P46093 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPR4P46093 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPR4P46093 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPR4P46093 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPR4P46093 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPR4P46093 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPR4P46093 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPR4P46093 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPR4P46093 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPR4P46093 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312.4 ms