Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRATP43155 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRATP43155 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRATP43155 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRATP43155 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRATP43155 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRATP43155 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRATP43155 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRATP43155 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRATP43155 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRATP43155 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRATP43155 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRATP43155 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRATP43155 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRATP43155 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRATP43155 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRATP43155 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRATP43155 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRATP43155 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRATP43155 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRATP43155 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRATP43155 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRATP43155 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CRATP43155 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRATP43155 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRATP43155 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRATP43155 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRATP43155 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRATP43155 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRATP43155 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRATP43155 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRATP43155 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRATP43155 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRATP43155 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CRATP43155 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CRATP43155 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRATP43155 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRATP43155 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRATP43155 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRATP43155 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRATP43155 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CRATP43155 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRATP43155 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRATP43155 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRATP43155 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRATP43155 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms