Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A1P43005 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A1P43005 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms