Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL35P42766 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL35P42766 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL35P42766 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL35P42766 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL35P42766 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL35P42766 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL35P42766 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL35P42766 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL35P42766 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL35P42766 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL35P42766 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL35P42766 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL35P42766 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPL35P42766 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPL35P42766 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPL35P42766 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPL35P42766 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL35P42766 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL35P42766 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL35P42766 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL35P42766 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL35P42766 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL35P42766 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL35P42766 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL35P42766 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL35P42766 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms