Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMPOP42166 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMPOP42166 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMPOP42166 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMPOP42166 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMPOP42166 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMPOP42166 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMPOP42166 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMPOP42166 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMPOP42166 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMPOP42166 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMPOP42166 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TMPOP42166 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TMPOP42166 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMPOP42166 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMPOP42166 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMPOP42166 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TMPOP42166 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMPOP42166 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMPOP42166 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TMPOP42166 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMPOP42166 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMPOP42166 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TMPOP42166 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMPOP42166 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMPOP42166 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMPOP42166 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMPOP42166 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMPOP42166 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMPOP42166 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMPOP42166 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMPOP42166 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMPOP42166 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMPOP42166 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMPOP42166 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMPOP42166 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMPOP42166 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMPOP42166 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMPOP42166 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMPOP42166 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMPOP42166 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMPOP42166 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMPOP42166 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMPOP42166 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TMPOP42166 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TMPOP42166 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMPOP42166 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMPOP42166 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMPOP42166 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMPOP42166 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TMPOP42166 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TMPOP42166 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMPOP42166 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMPOP42166 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMPOP42166 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMPOP42166 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMPOP42166 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMPOP42166 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMPOP42166 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMPOP42166 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMPOP42166 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMPOP42166 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TMPOP42166 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMPOP42166 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMPOP42166 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMPOP42166 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMPOP42166 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMPOP42166 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMPOP42166 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMPOP42166 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMPOP42166 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMPOP42166 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMPOP42166 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMPOP42166 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMPOP42166 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMPOP42166 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMPOP42166 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMPOP42166 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms