Protein–RNA interactions for Protein: P42127

ASIP, Agouti-signaling protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIPP42127 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASIPP42127 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASIPP42127 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASIPP42127 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASIPP42127 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASIPP42127 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASIPP42127 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASIPP42127 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIPP42127 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIPP42127 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIPP42127 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIPP42127 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIPP42127 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIPP42127 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIPP42127 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIPP42127 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIPP42127 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIPP42127 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIPP42127 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIPP42127 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIPP42127 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIPP42127 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIPP42127 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIPP42127 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIPP42127 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIPP42127 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIPP42127 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIPP42127 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIPP42127 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIPP42127 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIPP42127 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIPP42127 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIPP42127 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIPP42127 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIPP42127 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIPP42127 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIPP42127 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIPP42127 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIPP42127 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIPP42127 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIPP42127 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIPP42127 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIPP42127 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms