Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
APOBEC1P41238 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms