Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
IGHMBP2P38935 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHMBP2P38935 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms