Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ZEB1P37275 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms