Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms