Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL4P36578 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL4P36578 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL4P36578 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL4P36578 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL4P36578 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL4P36578 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL4P36578 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL4P36578 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL4P36578 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL4P36578 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL4P36578 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL4P36578 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL4P36578 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL4P36578 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL4P36578 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL4P36578 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL4P36578 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL4P36578 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL4P36578 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL4P36578 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL4P36578 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL4P36578 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL4P36578 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL4P36578 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL4P36578 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL4P36578 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL4P36578 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL4P36578 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL4P36578 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL4P36578 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL4P36578 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL4P36578 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL4P36578 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL4P36578 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL4P36578 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL4P36578 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL4P36578 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL4P36578 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL4P36578 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL4P36578 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL4P36578 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL4P36578 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL4P36578 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL4P36578 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL4P36578 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL4P36578 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL4P36578 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL4P36578 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL4P36578 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL4P36578 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL4P36578 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL4P36578 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL4P36578 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms