Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms