Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR5P32302 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR5P32302 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR5P32302 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms