Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX1P32242 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OTX1P32242 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OTX1P32242 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OTX1P32242 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OTX1P32242 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
OTX1P32242 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX1P32242 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX1P32242 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX1P32242 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX1P32242 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX1P32242 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX1P32242 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX1P32242 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX1P32242 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX1P32242 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX1P32242 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX1P32242 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX1P32242 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX1P32242 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OTX1P32242 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX1P32242 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX1P32242 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX1P32242 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX1P32242 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX1P32242 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX1P32242 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX1P32242 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX1P32242 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX1P32242 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX1P32242 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX1P32242 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX1P32242 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX1P32242 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTX1P32242 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX1P32242 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX1P32242 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX1P32242 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX1P32242 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX1P32242 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX1P32242 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX1P32242 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX1P32242 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX1P32242 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX1P32242 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX1P32242 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX1P32242 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX1P32242 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTX1P32242 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX1P32242 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX1P32242 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX1P32242 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX1P32242 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX1P32242 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX1P32242 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTX1P32242 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms