Protein–RNA interactions for Protein: P31323

PRKAR2B, cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2BP31323 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKAR2BP31323 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKAR2BP31323 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms