Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA10P31260 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA10P31260 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA10P31260 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA10P31260 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA10P31260 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXA10P31260 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXA10P31260 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXA10P31260 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA10P31260 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms