Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-FP30511 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms