Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP1P28562 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP1P28562 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms