Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CANXP27824 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CANXP27824 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CANXP27824 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CANXP27824 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CANXP27824 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CANXP27824 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CANXP27824 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CANXP27824 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CANXP27824 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CANXP27824 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CANXP27824 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CANXP27824 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CANXP27824 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CANXP27824 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CANXP27824 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CANXP27824 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CANXP27824 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CANXP27824 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CANXP27824 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CANXP27824 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CANXP27824 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CANXP27824 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CANXP27824 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CANXP27824 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CANXP27824 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CANXP27824 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CANXP27824 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CANXP27824 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CANXP27824 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CANXP27824 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CANXP27824 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CANXP27824 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CANXP27824 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CANXP27824 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CANXP27824 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CANXP27824 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CANXP27824 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CANXP27824 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CANXP27824 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CANXP27824 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CANXP27824 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CANXP27824 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CANXP27824 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CANXP27824 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CANXP27824 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CANXP27824 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CANXP27824 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CANXP27824 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CANXP27824 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CANXP27824 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CANXP27824 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CANXP27824 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CANXP27824 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CANXP27824 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CANXP27824 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CANXP27824 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CANXP27824 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CANXP27824 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CANXP27824 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CANXP27824 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CANXP27824 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CANXP27824 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CANXP27824 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CANXP27824 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CANXP27824 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CANXP27824 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CANXP27824 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CANXP27824 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CANXP27824 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CANXP27824 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CANXP27824 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CANXP27824 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CANXP27824 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CANXP27824 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CANXP27824 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CANXP27824 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CANXP27824 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CANXP27824 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CANXP27824 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CANXP27824 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CANXP27824 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CANXP27824 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CANXP27824 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CANXP27824 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CANXP27824 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CANXP27824 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CANXP27824 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CANXP27824 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CANXP27824 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CANXP27824 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CANXP27824 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CANXP27824 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CANXP27824 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CANXP27824 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CANXP27824 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CANXP27824 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CANXP27824 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CANXP27824 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CANXP27824 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms