Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE4AP27815 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4AP27815 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE4AP27815 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms