Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND1P24385 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND1P24385 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND1P24385 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND1P24385 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND1P24385 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND1P24385 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND1P24385 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND1P24385 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND1P24385 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND1P24385 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND1P24385 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND1P24385 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND1P24385 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND1P24385 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND1P24385 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND1P24385 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND1P24385 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND1P24385 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND1P24385 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND1P24385 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND1P24385 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND1P24385 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND1P24385 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND1P24385 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND1P24385 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND1P24385 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND1P24385 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND1P24385 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND1P24385 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND1P24385 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND1P24385 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND1P24385 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND1P24385 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND1P24385 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND1P24385 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND1P24385 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND1P24385 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND1P24385 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND1P24385 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCND1P24385 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCND1P24385 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms