Protein–RNA interactions for Protein: P22735

TGM1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM1P22735 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM1P22735 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM1P22735 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM1P22735 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM1P22735 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM1P22735 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM1P22735 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM1P22735 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM1P22735 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM1P22735 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM1P22735 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM1P22735 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM1P22735 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM1P22735 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TGM1P22735 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TGM1P22735 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM1P22735 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM1P22735 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM1P22735 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM1P22735 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM1P22735 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM1P22735 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM1P22735 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM1P22735 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM1P22735 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM1P22735 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM1P22735 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM1P22735 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM1P22735 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM1P22735 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM1P22735 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM1P22735 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM1P22735 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM1P22735 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM1P22735 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM1P22735 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM1P22735 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM1P22735 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM1P22735 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM1P22735 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM1P22735 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM1P22735 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM1P22735 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM1P22735 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM1P22735 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM1P22735 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM1P22735 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM1P22735 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM1P22735 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM1P22735 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM1P22735 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM1P22735 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM1P22735 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM1P22735 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM1P22735 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM1P22735 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM1P22735 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM1P22735 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM1P22735 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM1P22735 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM1P22735 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM1P22735 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM1P22735 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM1P22735 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM1P22735 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM1P22735 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM1P22735 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM1P22735 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM1P22735 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM1P22735 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM1P22735 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGM1P22735 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM1P22735 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM1P22735 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM1P22735 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM1P22735 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM1P22735 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM1P22735 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM1P22735 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM1P22735 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM1P22735 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGM1P22735 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TGM1P22735 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TGM1P22735 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM1P22735 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TGM1P22735 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms