Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK11BP21127 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms