Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB6AP20340 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB6AP20340 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms