Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCLP19338 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCLP19338 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCLP19338 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCLP19338 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCLP19338 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCLP19338 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCLP19338 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCLP19338 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCLP19338 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCLP19338 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCLP19338 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCLP19338 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLP19338 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLP19338 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLP19338 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLP19338 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLP19338 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLP19338 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLP19338 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLP19338 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLP19338 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLP19338 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLP19338 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLP19338 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLP19338 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCLP19338 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCLP19338 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCLP19338 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCLP19338 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCLP19338 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCLP19338 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCLP19338 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCLP19338 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCLP19338 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCLP19338 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCLP19338 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCLP19338 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCLP19338 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCLP19338 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCLP19338 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCLP19338 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCLP19338 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCLP19338 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NCLP19338 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NCLP19338 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCLP19338 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCLP19338 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NCLP19338 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NCLP19338 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NCLP19338 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCLP19338 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCLP19338 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NCLP19338 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NCLP19338 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCLP19338 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCLP19338 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCLP19338 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCLP19338 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCLP19338 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCLP19338 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCLP19338 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCLP19338 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLP19338 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLP19338 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLP19338 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLP19338 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLP19338 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLP19338 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLP19338 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLP19338 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLP19338 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLP19338 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLP19338 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLP19338 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLP19338 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCLP19338 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCLP19338 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NCLP19338 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCLP19338 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCLP19338 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NCLP19338 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCLP19338 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NCLP19338 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCLP19338 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCLP19338 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCLP19338 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCLP19338 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCLP19338 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCLP19338 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NCLP19338 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCLP19338 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCLP19338 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCLP19338 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCLP19338 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCLP19338 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCLP19338 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCLP19338 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCLP19338 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCLP19338 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms