Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN8P19075 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN8P19075 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN8P19075 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN8P19075 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN8P19075 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN8P19075 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN8P19075 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN8P19075 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSPAN8P19075 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSPAN8P19075 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSPAN8P19075 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN8P19075 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN8P19075 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN8P19075 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN8P19075 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN8P19075 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN8P19075 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN8P19075 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN8P19075 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN8P19075 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN8P19075 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN8P19075 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms