Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATF3P18847 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATF3P18847 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATF3P18847 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATF3P18847 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATF3P18847 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATF3P18847 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATF3P18847 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATF3P18847 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATF3P18847 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATF3P18847 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATF3P18847 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATF3P18847 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ATF3P18847 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATF3P18847 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATF3P18847 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATF3P18847 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATF3P18847 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATF3P18847 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATF3P18847 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATF3P18847 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATF3P18847 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATF3P18847 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATF3P18847 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATF3P18847 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ATF3P18847 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATF3P18847 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATF3P18847 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATF3P18847 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATF3P18847 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATF3P18847 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATF3P18847 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATF3P18847 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATF3P18847 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATF3P18847 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATF3P18847 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATF3P18847 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATF3P18847 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATF3P18847 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATF3P18847 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ATF3P18847 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ATF3P18847 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATF3P18847 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ATF3P18847 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ATF3P18847 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATF3P18847 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATF3P18847 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATF3P18847 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATF3P18847 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATF3P18847 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATF3P18847 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ATF3P18847 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATF3P18847 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATF3P18847 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATF3P18847 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATF3P18847 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATF3P18847 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATF3P18847 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATF3P18847 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATF3P18847 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATF3P18847 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATF3P18847 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ATF3P18847 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ATF3P18847 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATF3P18847 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATF3P18847 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ATF3P18847 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATF3P18847 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATF3P18847 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATF3P18847 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATF3P18847 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATF3P18847 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATF3P18847 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATF3P18847 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATF3P18847 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATF3P18847 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATF3P18847 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATF3P18847 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATF3P18847 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATF3P18847 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATF3P18847 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATF3P18847 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATF3P18847 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ATF3P18847 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATF3P18847 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATF3P18847 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATF3P18847 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ATF3P18847 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATF3P18847 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATF3P18847 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATF3P18847 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATF3P18847 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATF3P18847 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATF3P18847 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATF3P18847 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATF3P18847 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATF3P18847 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATF3P18847 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATF3P18847 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATF3P18847 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms