Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRAP18433 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
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