Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARF4P18085 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARF4P18085 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARF4P18085 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARF4P18085 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARF4P18085 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARF4P18085 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARF4P18085 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARF4P18085 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARF4P18085 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARF4P18085 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARF4P18085 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARF4P18085 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARF4P18085 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARF4P18085 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARF4P18085 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARF4P18085 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARF4P18085 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF4P18085 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF4P18085 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF4P18085 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF4P18085 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF4P18085 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF4P18085 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF4P18085 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF4P18085 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF4P18085 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF4P18085 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF4P18085 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF4P18085 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF4P18085 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARF4P18085 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARF4P18085 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARF4P18085 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARF4P18085 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARF4P18085 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARF4P18085 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARF4P18085 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARF4P18085 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARF4P18085 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARF4P18085 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARF4P18085 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARF4P18085 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARF4P18085 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARF4P18085 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARF4P18085 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARF4P18085 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARF4P18085 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARF4P18085 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARF4P18085 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF4P18085 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARF4P18085 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARF4P18085 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARF4P18085 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARF4P18085 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARF4P18085 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARF4P18085 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARF4P18085 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARF4P18085 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARF4P18085 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARF4P18085 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ARF4P18085 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF4P18085 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF4P18085 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF4P18085 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF4P18085 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF4P18085 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF4P18085 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF4P18085 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF4P18085 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF4P18085 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF4P18085 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF4P18085 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF4P18085 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF4P18085 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF4P18085 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARF4P18085 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARF4P18085 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARF4P18085 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARF4P18085 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARF4P18085 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms