Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCP1P17987 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCP1P17987 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCP1P17987 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCP1P17987 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TCP1P17987 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TCP1P17987 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCP1P17987 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCP1P17987 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCP1P17987 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCP1P17987 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCP1P17987 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCP1P17987 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCP1P17987 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCP1P17987 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCP1P17987 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCP1P17987 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCP1P17987 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCP1P17987 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCP1P17987 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCP1P17987 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCP1P17987 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCP1P17987 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCP1P17987 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCP1P17987 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCP1P17987 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCP1P17987 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCP1P17987 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCP1P17987 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCP1P17987 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCP1P17987 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCP1P17987 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCP1P17987 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCP1P17987 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCP1P17987 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCP1P17987 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCP1P17987 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCP1P17987 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCP1P17987 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCP1P17987 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCP1P17987 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCP1P17987 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCP1P17987 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCP1P17987 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCP1P17987 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCP1P17987 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCP1P17987 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCP1P17987 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCP1P17987 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCP1P17987 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCP1P17987 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCP1P17987 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCP1P17987 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCP1P17987 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCP1P17987 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCP1P17987 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCP1P17987 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCP1P17987 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCP1P17987 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCP1P17987 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCP1P17987 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCP1P17987 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCP1P17987 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCP1P17987 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCP1P17987 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCP1P17987 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCP1P17987 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCP1P17987 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCP1P17987 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCP1P17987 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCP1P17987 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCP1P17987 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCP1P17987 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCP1P17987 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCP1P17987 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms