Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FLT1P17948 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FLT1P17948 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FLT1P17948 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FLT1P17948 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FLT1P17948 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FLT1P17948 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FLT1P17948 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FLT1P17948 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FLT1P17948 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FLT1P17948 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FLT1P17948 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FLT1P17948 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FLT1P17948 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FLT1P17948 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FLT1P17948 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
FLT1P17948 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FLT1P17948 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FLT1P17948 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FLT1P17948 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FLT1P17948 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FLT1P17948 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FLT1P17948 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FLT1P17948 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FLT1P17948 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FLT1P17948 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FLT1P17948 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FLT1P17948 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FLT1P17948 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FLT1P17948 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FLT1P17948 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FLT1P17948 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FLT1P17948 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FLT1P17948 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FLT1P17948 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FLT1P17948 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FLT1P17948 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FLT1P17948 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FLT1P17948 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FLT1P17948 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FLT1P17948 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FLT1P17948 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FLT1P17948 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FLT1P17948 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FLT1P17948 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FLT1P17948 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FLT1P17948 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FLT1P17948 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FLT1P17948 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FLT1P17948 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FLT1P17948 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FLT1P17948 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FLT1P17948 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FLT1P17948 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FLT1P17948 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FLT1P17948 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FLT1P17948 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FLT1P17948 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FLT1P17948 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FLT1P17948 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FLT1P17948 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FLT1P17948 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FLT1P17948 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FLT1P17948 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FLT1P17948 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FLT1P17948 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FLT1P17948 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FLT1P17948 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FLT1P17948 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FLT1P17948 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FLT1P17948 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FLT1P17948 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FLT1P17948 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FLT1P17948 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FLT1P17948 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FLT1P17948 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FLT1P17948 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FLT1P17948 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FLT1P17948 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
FLT1P17948 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FLT1P17948 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
FLT1P17948 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FLT1P17948 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FLT1P17948 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FLT1P17948 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms