Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GM2AP17900 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GM2AP17900 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GM2AP17900 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GM2AP17900 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GM2AP17900 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GM2AP17900 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GM2AP17900 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GM2AP17900 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GM2AP17900 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GM2AP17900 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GM2AP17900 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GM2AP17900 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GM2AP17900 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GM2AP17900 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GM2AP17900 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GM2AP17900 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GM2AP17900 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GM2AP17900 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GM2AP17900 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GM2AP17900 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GM2AP17900 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GM2AP17900 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GM2AP17900 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GM2AP17900 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GM2AP17900 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GM2AP17900 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GM2AP17900 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GM2AP17900 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GM2AP17900 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms