Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSCAN20P17040 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSCAN20P17040 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms