Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDE6AP16499 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE6AP16499 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms