Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTLA4P16410 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTLA4P16410 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTLA4P16410 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTLA4P16410 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTLA4P16410 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTLA4P16410 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTLA4P16410 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTLA4P16410 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CTLA4P16410 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms