Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD46P15529 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD46P15529 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD46P15529 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD46P15529 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD46P15529 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD46P15529 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD46P15529 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD46P15529 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD46P15529 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD46P15529 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD46P15529 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD46P15529 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD46P15529 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CD46P15529 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD46P15529 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD46P15529 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD46P15529 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD46P15529 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD46P15529 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD46P15529 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD46P15529 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD46P15529 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD46P15529 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD46P15529 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD46P15529 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD46P15529 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD46P15529 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD46P15529 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD46P15529 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD46P15529 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD46P15529 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD46P15529 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD46P15529 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CD46P15529 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD46P15529 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD46P15529 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD46P15529 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD46P15529 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD46P15529 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD46P15529 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD46P15529 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD46P15529 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD46P15529 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD46P15529 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD46P15529 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD46P15529 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD46P15529 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms