Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA1P15085 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA1P15085 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPA1P15085 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPA1P15085 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPA1P15085 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPA1P15085 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPA1P15085 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA1P15085 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA1P15085 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA1P15085 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA1P15085 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA1P15085 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA1P15085 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA1P15085 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA1P15085 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA1P15085 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA1P15085 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA1P15085 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA1P15085 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA1P15085 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA1P15085 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA1P15085 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA1P15085 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA1P15085 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA1P15085 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPA1P15085 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA1P15085 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA1P15085 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA1P15085 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA1P15085 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA1P15085 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA1P15085 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA1P15085 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA1P15085 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA1P15085 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA1P15085 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA1P15085 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA1P15085 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA1P15085 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA1P15085 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA1P15085 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA1P15085 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA1P15085 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA1P15085 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA1P15085 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA1P15085 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA1P15085 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPA1P15085 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA1P15085 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA1P15085 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA1P15085 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA1P15085 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA1P15085 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA1P15085 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA1P15085 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA1P15085 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA1P15085 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA1P15085 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA1P15085 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA1P15085 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA1P15085 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA1P15085 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA1P15085 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA1P15085 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA1P15085 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA1P15085 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA1P15085 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA1P15085 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA1P15085 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA1P15085 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA1P15085 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA1P15085 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA1P15085 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA1P15085 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA1P15085 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA1P15085 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA1P15085 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA1P15085 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA1P15085 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA1P15085 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA1P15085 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA1P15085 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA1P15085 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA1P15085 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms