Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2F2P13984 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2F2P13984 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms