Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VPREB1P12018 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms