Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODC1P11926 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODC1P11926 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODC1P11926 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODC1P11926 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODC1P11926 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODC1P11926 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODC1P11926 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ODC1P11926 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODC1P11926 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODC1P11926 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODC1P11926 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ODC1P11926 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODC1P11926 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODC1P11926 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODC1P11926 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODC1P11926 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ODC1P11926 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODC1P11926 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODC1P11926 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODC1P11926 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODC1P11926 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODC1P11926 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODC1P11926 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ODC1P11926 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODC1P11926 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODC1P11926 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODC1P11926 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODC1P11926 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ODC1P11926 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODC1P11926 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODC1P11926 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODC1P11926 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODC1P11926 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODC1P11926 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODC1P11926 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODC1P11926 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODC1P11926 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODC1P11926 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODC1P11926 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ODC1P11926 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODC1P11926 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ODC1P11926 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODC1P11926 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODC1P11926 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODC1P11926 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODC1P11926 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODC1P11926 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODC1P11926 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ODC1P11926 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODC1P11926 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODC1P11926 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODC1P11926 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ODC1P11926 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ODC1P11926 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODC1P11926 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODC1P11926 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODC1P11926 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODC1P11926 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODC1P11926 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ODC1P11926 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ODC1P11926 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ODC1P11926 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ODC1P11926 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ODC1P11926 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODC1P11926 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODC1P11926 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODC1P11926 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODC1P11926 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODC1P11926 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODC1P11926 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ODC1P11926 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms